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https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/1546| Tipo: | Trabalho de Conclusão de Curso |
| Título: | Redução de cruzamento de arestas em desenhos de sistemas biológicos |
| Autor(es): | Lautert, Douglas Paim |
| Primeiro Orientador: | Pinto, Marcelo Cezar |
| Resumo: | O trabalho trata da aplicação do algoritmo Fruchterman e Reingold da linha de pesquisa de Desenho de Grafo para melhoria de visualizações de dados biológicos advindos de pesquisas realizadas na linha de Biologia Sistêmica. Desenho de Grafo utiliza conceitos de grafos para geração de novos layouts. Enquanto que Biologia Sistêmica estuda sistemas biológicos e as suas interações. A aplicação de Desenho de Grafos em Biologia Sistêmica é uma integração de áreas distintas e serve para que o conhecimento científico se torne mais facilmente compreendido entre os pesquisadores de Biologia Sistêmica, através de diagramas SBGN que tem como principal critério estético a redução de cruzamento de arestas. Assim a ferramenta SBLgen criada, através de modelos biológicos em SBML, cria layous de forma clara e intuitiva para dar suporte aos pesquisadores de Biologia Sistêmica no que diz respeito à Visualização Científica de seus dados. |
| Abstract: | This work applies Fruchterman & Reingold Graph Design area algorithm to improve biological data visualization from Systems Biology research. Graph Design uses Graph concepts to generate new layouts and Systems Biology deals with biological systems and their interactions. The integration of Graph Design and Systems Biology guarantees that scientific knowledge could be easily understood to researchers. The main aesthetic criterion for SBGN diagrams adopted in this work is edge crossing minimization. So, the devised SBLGen tool, acting after VANTED software conversion of SBML models to GML files, creates intuitive and clear layouts to support Systems Biology researchers to visualize its data. |
| Palavras-chave: | Computer science Systems biology Graph drawing Biological systems Ciência da computação Biologia sistêmica Desenho de grafos Sistemas biológicos |
| CNPq: | CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA |
| Editor: | Universidade Federal do Pampa |
| Campus: | Campus Alegrete |
| Tipo de Acesso: | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil |
| Licença: | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ |
| URI: | http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/1546 |
| Data do documento: | 28-Jun-2011 |
| Aparece nas coleções: | Ciência da Computação |
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