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Tipo: Trabalho de Conclusão de Curso
metadata.dc.title: Redução de cruzamento de arestas em desenhos de sistemas biológicos
Autor(es): Lautert, Douglas Paim
Primeiro Orientador: Pinto, Marcelo Cezar
Resumo: O trabalho trata da aplicação do algoritmo Fruchterman e Reingold da linha de pesquisa de Desenho de Grafo para melhoria de visualizações de dados biológicos advindos de pesquisas realizadas na linha de Biologia Sistêmica. Desenho de Grafo utiliza conceitos de grafos para geração de novos layouts. Enquanto que Biologia Sistêmica estuda sistemas biológicos e as suas interações. A aplicação de Desenho de Grafos em Biologia Sistêmica é uma integração de áreas distintas e serve para que o conhecimento científico se torne mais facilmente compreendido entre os pesquisadores de Biologia Sistêmica, através de diagramas SBGN que tem como principal critério estético a redução de cruzamento de arestas. Assim a ferramenta SBLgen criada, através de modelos biológicos em SBML, cria layous de forma clara e intuitiva para dar suporte aos pesquisadores de Biologia Sistêmica no que diz respeito à Visualização Científica de seus dados.
Abstract: This work applies Fruchterman & Reingold Graph Design area algorithm to improve biological data visualization from Systems Biology research. Graph Design uses Graph concepts to generate new layouts and Systems Biology deals with biological systems and their interactions. The integration of Graph Design and Systems Biology guarantees that scientific knowledge could be easily understood to researchers. The main aesthetic criterion for SBGN diagrams adopted in this work is edge crossing minimization. So, the devised SBLGen tool, acting after VANTED software conversion of SBML models to GML files, creates intuitive and clear layouts to support Systems Biology researchers to visualize its data.
metadata.dc.subject: Computer science
Systems biology
Graph drawing
Biological systems
Ciência da computação
Biologia sistêmica
Desenho de grafos
Sistemas biológicos
CNPQ: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA
metadata.dc.publisher: Universidade Federal do Pampa
Campus: Campus Alegrete
Tipo de acesso: Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
Licença: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
metadata.dc.identifier.uri: http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/1546
metadata.dc.date.issued: 28-Jun-2011
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