???jsp.display-item.identifier??? https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/4525
Tipo: Trabalho de Conclusão de Curso
metadata.dc.title: Otimização de protocolo para a amplificação via PCR de marcadores SSR em Eugenia uniflora l. (Myrtaceae)
Autor(es): Beise, Dalvan Carlos
Primeiro Orientador: Stefenon, Valdir Marcos
1° Membro da banca: D'Ávila , Marícia Fantinel
2° Membro da banca: Neves, Patrícia de Oliveira
Resumo: A espécie Eugenia uniflora L., popularmente conhecida como pitangueira, pertence à família Myrtaceae e apresenta ampla distribuição pela América do Sul, sendo nativa para os biomas Mata Atlântica e Pampa. A pitangueira possui importância significativa pela grande apreciação de seus frutos tanto pelo homem quanto pela fauna em geral. Tendo sido empregada pela medicina popular há várias gerações, atualmente o setor econômico tem notado sua qualidade para a confecção de produtos alimentícios, farmacológicos e cosméticos. Devido essa possibilidade de exploração, consequentemente haverá redução das áreas onde a mesma ocorre naturalmente. Estudos com base genético-molecular são fundamentais para compreensão dos efeitos causados pela da fragmentação e degradação do ambiente, refletidos no comportamento populacional das espécies como um todo. Para isso, é necessário desenvolver ferramentas capazes de elucidar as variações de indivíduos em nível populacional. Por esses motivos, o presente trabalho teve como objetivo testar e avaliar a eficiência da amplificação dos locus microssatélites específicos para a espécie E. uniflora, previamente caracterizados e validados in silico. Para amplificação dos 24 loci avaliados, utilizou-se indivíduos pertencentes a uma população natural de um fragmento florestal de Mata Atlântica. Dentre os loci avaliados, 12 mostraram-se eficientes, podendo ser diretamente indicados para aplicações futuras. Para os que não apresentaram bons resultados, é necessária a realização de novos testes e ajustes em relação aos protocolos adotados. Por fim, apenas sete foram descartados por não apresentarem amplificação. Esta avaliação foi baseada na amplificação dos loci visualizados através de eletroforese em gel de agarose 2%. Ainda, buscou-se otimizar um protocolo de PCR (Reação em cadeia da polimerase) visando o aumento do número de loci amplificados. A origem genômica dos loci foi caracterizada por meio de um BLAST (Ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local) realizado no banco de dados online NCBI, demonstrando uma alta similaridade das sequências alinhadas com a espécie Eucalyptus grandis, também pertencente à família Myrtaceae.
Abstract: The species Eugenia uniflora L., popularly known as pitangueira, belongs to the Myrtaceae family and is widely distributed throughout South America, being native to the Mata Atlântica and Pampa biomes. The pitangueira has significant importance for the great appreciation of its fruits for both the man and the fauna in general. Having been employed by popular medicine for several generations, nowadays the economic sector has noticed its quality for the manufacture of food, pharmacological and cosmetic products. Due to this possibility of exploitation, consequently there will be reduction of the areas where it occurs naturally. Geneticmolecular studies are fundamental to understanding the effects of fragmentation and degradation of the environment, reflected in the population behavior of the species as a whole. For this, it is necessary to develop tools capable of elucidating the variations of individuals at the population level. For these reasons, the present work had as objective to test and to evaluate the efficiency of the amplification of the microsatellite locus specific for the species E. uniflora, previously characterized and validated in silico. For amplification of the 24 loci evaluated, we used individuals belonging to a natural population of a forest fragment of Atlantic Forest. Among the evaluated loci, 12 were efficient and could be directly indicated for future applications. For those that did not present good results, it is necessary to perform new tests and adjustments in relation to the adopted protocols. Finally, only seven were discarded for lack of amplification. This evaluation was based on amplification of loci visualized by 2% agarose gel electrophoresis. In addition, a PCR (Polymerase Chain Reaction) protocol was optimized aiming at increasing the number of amplified loci. The genomic origin of the loci was characterized by a BLAST (Basic alignment search tool) performed in the online database NCBI, demonstrating a high similarity of the sequences aligned with the species Eucalyptus grandis, also belonging to the family Myrtaceae.
metadata.dc.subject: Myrtaceae
Fragmentação de ambiente
Pitangueira
Variação individual
Marcadores SSR
SSR markers
Environmental fragmentation
Individual variation
CNPQ: CNPQ::CIENCIAS SOCIAIS APLICADAS
Idioma: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
metadata.dc.publisher: Universidade Federal do Pampa
Sigla da Instituição: UNIPAMPA
Campus: Campus São Gabriel
metadata.dc.identifier.citation: BEISE, Dalvan Carlos. Otimização de protocolo para a amplificação via PCR de marcadores SSR em Eugenia uniflora l. (Myrtaceae).2018. 50 f. Trabalho de conclusão de Curso (Curso Ciências Biológicas Bacharelado). Universidade Federal do Pampa. Campus São Gabriel. São Gabriel. 2018.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
metadata.dc.identifier.uri: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/4525
metadata.dc.date.issued: 14-Dec-2018
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Otmiação de protocolo para amplificação via PCR de marcadores SSR em Eugenia uniflora L. (Myrtaceae).pdf879.67 kBAdobe PDF???org.dspace.app.webui.jsptag.ItemTag.view???


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